こんにちは。

自分も刈谷勇さんと一緒で、ある程度クラスができてきてから
Regionで整理するようにしています。

後は、以前＠ITで紹介されていた「Source Code Outliner PowerToy」が結構便利ですかね。
ソースファイル単体でメンバ表示できたりするので多少探すのも楽になるかもしれません。

＠IT NET TIPS
Visual StudioのIDEでソース・ファイル内のメンバをツリー表示するには？［VS 2005、VS 2008］
http://www.atmarkit.co.jp/fdotnet/dotnettips/851srcoutliner/srcoutliner.html