大分混乱しているようで変な事言って申し訳ないです。
Do Whileループは特定の行だけを書き込むためにReadLineをもちいて
行を送っていくものでした。
一次元配列内のデータを二次元配列に持っていくときに
一度変数に格納してから行くようにしようとしていたのですが、
aではなくほかの変数を使ってやらねばならなかったようです。

おかげさまでようやく進みそうです。
ありがとうございました。