アイコンのサイズであれば、[ユーザー設定]ダイアログの[オプション]タブで変更できますが、
個々のウィンドウの位置やサイズをリセットする機能はありません。


なおウィンドウの位置は、レジストリの
　HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Visual Basic\6.0\Dock
に保存されています。

そのため、ウィンドウの位置を頻繁に変更する必要がある場合には、
インストール直後の上記レジストリを、*.reg ファイルに
エクスポートしておくと便利だと思います。
(用意しておいた reg ファイルダブルクリックすることで、ウィンドウ位置を復元できます)