わざわざそのようにたくさんの変数を置かなくても、
Timer1のIntervalを3000にしてBeep()を呼び出せばいいと思います。

Button1,2,Timer1を置いて、作ってみました。
Button1を押すと始まって、Button2を押すと止まります。

Public Class Form1



    Private Sub Button1_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles Button1.Click

        timer1.start()

    End Sub



    Private Sub Button2_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles Button2.Click

        Timer1.Stop()

    End Sub



    Private Sub Timer1_Tick(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles Timer1.Tick

        Beep()

    End Sub

End Class