Vista Ultimate/Win7 Ultimate（両方32ビット）
Core2Quad 2.84 GHz
MEM:4GB(有効3GB)
HDD:STAT2(500GB+500GB+1TB) 7200回転

C:は、64GBで空き18GBですが・・・
そんなに重いと云う感触は無いです。

ＨＤＤのフラグメンテーションが進んでいるとか・・・

HDDのインターフェースの種類は？
あとチップセット等のドライバーのバージョンは古くないですか？

以上。参考まで