よねKENさんの言うとおり、

Call GetData1()     'Closeなし
Call GetData2()     'Closeあり

では100%例外が発生し、

Call GetData1()     'Closeなし 
GC.Collect() 
GC.WaitForPendingFinalizers()  ' Finalize≒Dispose≒Closeの処理完了を確実に待つため
Call GetData2()     'Closeあり

では例外が発生しませんでした。
（ガベージコレクターに関しては今回初めて知りました。）

ということは、SqlConnectionの重複使用による例外を回避するには

１．接続文字列のオプションでMARSを有効にする
２．SqlDataReaderの取得前にガベージコレクションを強制実行する

の２通りの方法で問題ないでしょうか。
もちろん、上記は本来作りたかったものとは異なる部分もあるでしょうし、
再度コードを見直して他にもSqlDataReaderのCloseが抜けている箇所がないか
確認するというのは前提として。