> MyTrashCanというフリーソフトを知っていますか？
検索したらゴミ箱のアイコン変更ツールでした。

> あのソフトのように透過されたpng画像を表示
アイコンファイルじゃないの？

> TransparencyKeyなども試してみましたがどうもうまくいきません。
[DOBON.NET フォームウィンドウの特定の色を透明にする]
http://dobon.net/vb/dotnet/form/transparencykey.html
『うまくいきません』ではどういう結果が得られたのかが
伝わりませんので、どういった情報が必要なのか分かりません。
とりあえず、上記リンクの
> うまくいかない場合は？
に該当するなら、それ以降のコードを試してみてください。