シリアルポートで通信ですか？ 
最初にも書いたように私はLinuxはよくわからないのですが、シリアルポートでWindowsとLinuxが通信するというのはなんだか想像ができません。 
私が知らないだけでよくあることなんでしょうか…。 
ひょっとするとLinux側はPCではなくて何かの組み込み機器でしょうか。 
 
とりあえず、VBからシリアルポートを制御するにはSystem.IO.Ports名前空間のSerialPortクラスを使用します。 
これも私は経験はありません。 
 
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/system.io.ports.serialport.aspx 
 
検索したら詳しそうなサイトがあったので参考に紹介します。 
http://www.technoveins.co.jp/dev/vb2005/serialport.htm