こんにちは。

エアログラスの背景色をプログラムから指定することはおそらくできません。
背景色を指定するのはプログラムではなく、Windowsにログオンしているユーザー自身です。

自作アプリケーションでエアログラスを使用した場合の色は
ユーザーが個人設定で指定したウィンドウの色になります。

なので同じプログラムでもウィンドウの色をピンクにしているユーザーにはそのウィンドウはピンク色のすりガラスに見えます。

参考：MSDNマガジン「デスクトップ ウィンドウ マネージャを使用して特殊効果を施す」
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/cc163435.aspx

xvmmtnkさんが参考にしているサイトの記事もMSDNマガジンから着想しているようですね。