Graphicsへの描画を対象とした場合、
点というのは半径０の円とか０×０の四角とかになるので
描画することが出来ません。なので
Graphics.FillRectangle で両方の辺を短めにした四角を描くか
Graphics.FillEllipse で半径の小さい円を描くことになります。

Bitmapを使用した場合、Pixcel単位の操作が可能なので
Bitmap.SetPixelを使用すれば点を書くことが出来ます。
点の数が多い場合はLockBitsをして配列に転送して
配列の書き換えをしてUnLockBitsする方法が処理が速いです。
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/5ey6h79d(v=vs.80).aspx
を参照のこと