> C:\Program Files\Microsoft Visual Studio 8\Common7\IDE>VBExpress.exe /ResetSkipPkgs
>
> 'VBExpress.exe' は、内部コマンドまたは外部コマンド、
> 操作可能なプログラムまたはバッチ ファイルとして認識されていません。

うーん。パスはあっていそうなのですけれどね。

"C:\Program Files\…\VBExpress.exe" /ResetSkipPkgs
などのように、VBExpress.exe へのフルパスで指定しては如何でしょう。
(空白を含むパスなので、両端に「"」が必要です)

なお、「vbexpress.exe /?」のように　/? パラメータを利用すると、
利用可能なコマンドラインパラメータが表示されるとのことです。
(手元に Express 版がないので未確認です)