>コマンドも打って、初期設定のダイアログがでてきて、初期化は終わったと思うのですが、改善されません。
とりあえず初期化はできたのですね。

そういえばなぜVB2008EEを使おうと思っているのですか？VB6からVB2008への変換機能を使いたいからでしょうか？
強制終了する前に追加した機能等（強制終了する以前にした操作）は覚えていますか？VB2010を入れてからそうなったとか、VB2010のエディションはわかりませんが、VS2010へ追加機能を入れたからそうなったのか。みたところ、VB2010にはWindows Media Playerが入っているみたいですが。

もしかしたらVB2010が原因かもしれません。同じようにVB2010も初期化したらいかがでしょう？