私の環境で、WaveIFを試しました。
ミキサーは、選択ではなく、ミュートを外す設定でした。
PCで再生している音は、録音できました。
WaveIFのページを調べましたが、現在アクセスできない状態みたいです。
http://www32.ocn.ne.jp/~kentaro/Software/Samples/index.html
↑VB2010用で、録音してWAVEファイルに落とすサンプルコードがありますが
現在アクセスできません。
録音だけでしたら、ミキサーが選択できれば、MCIでも可能と思いますが・・・・。
お役に立てずすいません・・。