競合エラーとはなんでしょうか？
VBでエラーが発生しているのでしたら具体的な情報をお願いします。

>ファイルのアクセスが競合エラーになります
>時々処理が帰ってこなくなります（ハング）エラーは出ません
>サーバ側では、abortingのエラーになります
状況がよくわかりません…。

知見のある人が読んだだけで状況を理解して回答してくれればよいのですが、
そうでない場合FTPは試すのが面倒なのでコピー＆貼り付けだけで実際に動かしてエラーが再現できるものを載せると良いと思います。
(FTPサーバーだけは各自設定する必要がありますが)