こんにちは。

VisualStudioがプロフェッショナルなら難読化プログラムが付いているはずです。
難読化ですが、どこまで行うかが結構問題です。
下手にやりすぎるとプログラムが正常に動作しなくなります。

自分は難読化はしません。
ぽこたさんが言うようにコストの割に効果がないと思うからです。

ある程度技術のある人の場合、逆コンパイルしてまで得るものは無いでしょうし、
難読化していても読めますし。
技術が無い人は使えるものがあるかもしれませんが、なぜそうなっているかまでは判らず、
それ以上の事が出来ないと思っているからです。

本当に流出を防ぎたいのであればC++での開発をお勧めします。