はぁ、またミスってました。こんなの書くから･･･

    Private Sub FMBase_Load(sender As System.Object, e As System.EventArgs) Handles MyBase.Load

        me.hide   'FMBaseが表示されていてもよければ、必要なし  

        using Login As new FmLogin

          if Login.showdialog(Me) <> Windows.Forms.DialogResult.OK then

            me.close

          end if

        End using

        me.show 'me.hideしないなら、必要なし  

    End Sub

のme.hide／me.showは意味がないですね。LoadイベントではMeはまだ表示されていなかったはず？

それと、スタートアップフォームという名前はプロジェクトのプロパティで
「アプリケーションフレームワークを有効にする」
にチェックがある場合で、チェックをはずすとスタートアップオブジェクトへと表示が変わります＾＾；