赤バツは、レンダリングエラー時に表示されることがあります。
（レンダリングされていないだけならば、単に白くなるか、残像が残るだけですが）

一例としては、DoEvents によるイベント再入などにより、セルの描画中に
バインドデータが変更された場合などでしょうか。

単純な再現実験としてはこんなのとか。

Public Class Form1

    Private tbl1, tbl2 As DataTable

    Private Sub Form1_Load(sender As Object, e As EventArgs) Handles MyBase.Load

        tbl1 = New DataTable()

        tbl1.Columns.Add("F1")

        tbl1.Columns.Add("F2")

        For n = 1 To 1000

            tbl1.Rows.Add(CStr(n), StrDup(n, "@"))

        Next



        tbl2 = New DataTable()

        tbl2.Columns.Add("F1")

        tbl2.Columns.Add("F2")

        For n = 1 To 1000

            tbl2.Rows.Add(CStr(n), StrDup(n, "="))

        Next



        Me.DataGridView1.DataSource = tbl1

    End Sub



    Private Sub DataGridView1_CellPainting(sender As Object, e As DataGridViewCellPaintingEventArgs) Handles DataGridView1.CellPainting

        If e.RowIndex < 500 Then

            Me.DataGridView1.DataSource = tbl1

        Else

            Me.DataGridView1.DataSource = tbl2

        End If

    End Sub

End Class