> ドラッグ＆ドロップし
ドロップされたファイル名を取得する方法は、下記を参照してみて下さい。
http://dobon.net/vb/dotnet/control/droppedfile.html

これでファイル名を得た後、そのファイルの中身を読み取り、
その内容を編集して別名保存するという流れになりますね。


> 既存のExcelファイル

これは CSV ファイルやタブ区切りテキストではなく、
*.xlsx ファイルのことでしょうか?

CSV 出力であれば、「VB CSV 出力」などのキーワードで検索すれば、
いろいろなサンプルが見つかるかと思います。基本的には、
VB.NET や .NET Framework の標準機能だけで処理できるでしょう。


一方、Excel のバイナリファイルだとすると、読み書きには
出力可能な専用ライブラリが別途必要となり、実装難易度が上がります。

Excel 出力可能ならライブラリの例：
　・EPPlus
　・NPOI
　・ClosedXML
　・Microsoft.Office.Interop.Excel
　・ACEDAO