いろいろ突っ込み所ありすぎるんだけど・・・ね。

Databaseの質問をするときは、データベース名、ミドルウエア名を書こうね。
Databaseもミドルウエアもいろいろあるから。

まあ、君のはSQLServer2008 Express Editionで、ADO.NETだとは予想できるけど。
そういうのをちゃんと書けるようになった方が君の為だと思うけどね。

（1）1000件程度はそんなに時間かかんない。テーブル設計が悪いんじゃない？
（2）そういうことをしないためにDatabaseがあるんだけど。
（3）クエリ覚えたら？