可能であれば、サンプルとなりそうな具体的な URL を挙げて頂けると話を進めやすいです。


> 内部的？には入力されていない状態のままで、

恐らくは、onchange などの変更通知イベントが発生していないのだと思います。
http://dobon.net/cgi-bin/vbbbs/cbbs.cgi?mode=all&namber=33445&type=0&space=0&no=0