追記
対象とするWindowsを何れにするかというのも、
.NET Frame work のバージョンを選ぶ基準です。
’
.NET Framework のバージョンおよび依存関係
https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/bb822049(v=vs.110).aspx
.net framework 対応os
https://www.google.co.jp/search?hl=ja&q=moug&lr=lang_ja&gws_rd=ssl#lr=lang_ja&hl=ja&tbs=lr:lang_1ja&q=.net+framework+%E5%AF%BE%E5%BF%9Cos&spf=1497234123409
’
個人での実装例、
As/R：ファイラー（まめファイルの後継）
http://www.all.undo.jp/asr/
これなどは、適度に配慮出来ていて、
且つ、.NET Framework のインストーラ問題に煩わされない配慮になっているのでは？