Private Sub butGPIBInit_Click
の
Dim f As New Master
を
Form内のPrivate変数として定義
Private f As Master

f.Owner = Me
f.Show()

の前に　f = New Master()

Private Sub cmbGPIB_SelectedIndexChanged
の
         Dim f As New Master
         f.Owner = Me
を削除

これでどんな動きになるでしょう？