6cly0yyOPNcv52xbHVttEsuVTI= という名前はbase64でエンコードされた文字列のように見えますが、ためしにデコードしてみるとエラーでした。どうもbase64としては不完全なもののようです。

>（３）作成されるソースと作成されないソースがあります。
>想像ですが、プロジェクトのソールフォルダーの直下に *.sln 以外のファイルがあるものが作成されるようです。
>その違いは、Visual Studio 2019 にて新規作成したプロジェクトのような気がします。
いまいち状況がわからないです。

必ず再現する手順があるんでしょうか？
また、必ず再現しない手順もあるんでしょうか？

ご質問は、Cドライブ直下にあるなぞの 6cly0yyOPNcv52xbHVttEsuVTI= という名前のフォルダーは一体何かということですよね？