何の機能を使っているか、何をプログラムしようとしているか、で最適な答えは変わってきます。

とりあえず、Windowsフォームアプリケーションで Graphicsクラスの機能を使って描画していて、とにかく左下が原点になれば何でも良いということで回答してみます。
(この前提が変わると回答もまったく違う回答になる場合があります。)

Graphicsクラスは TranslateTransformメソッドで原点を指定することができますので、簡単に原点を変更できます。
たとえば、e.Graphics.TranslateTransform(100, 200) と書くと、これ以降は、それまでの点(100, 200)が今後の原点になります。
フォームの左下の座標は (0, Me.ClientSize.Height)なので、e.Graphics.TranslateTransform(0, Me.ClientSize.Height) と記述すると、それ以降はフォームの左下が原点になります。ユーザーがマウスでフォームのサイズを変更したときにはこのTranslateTransformを再実行する必要があります。

もう１つ、質問には書いてありませんでしたが、イヨさんはおそらく Y軸で上方向がプラスである座標系を扱いたいのではないかと推測します。これも簡単にできます。
e.Graphics.ScaleTransform(1, -1)  と記述すると、その後は、Y軸が反転して上方向がプラスになります。

サンプルを紹介します。

Public Class Form1

    Private Sub Form1_Paint(sender As Object, e As PaintEventArgs) Handles MyBase.Paint





        'この2行をコメントにすると通常の座標系になります。 

        e.Graphics.TranslateTransform(0, Me.ClientSize.Height) '左下(つまり、0,Me.ClientSize.Height)を新しい原点にする。 

        e.Graphics.ScaleTransform(1, -1) 'Y軸方向を反転させる。つまり上方向がプラスになる。 



        '背景を黒にする 

        e.Graphics.Clear(Color.Black)



        '三角形 

        e.Graphics.DrawLine(Pens.LightBlue, 300, 20, 200, 193)

        e.Graphics.DrawLine(Pens.LightBlue, 200, 193, 400, 193)

        e.Graphics.DrawLine(Pens.LightBlue, 400, 193, 300, 20)



        '円A(青) 

        e.Graphics.FillEllipse(Brushes.Blue, 290, 10, 20, 20)

        e.Graphics.DrawString("A", Me.Font, Brushes.LightCyan, 295, 15)

        e.Graphics.DrawString("x=300, y=20", Me.Font, Brushes.LightCyan, 312, 15)



        '円B(赤) 

        e.Graphics.FillEllipse(Brushes.Red, 190, 183, 20, 20)

        e.Graphics.DrawString("B", Me.Font, Brushes.LightCyan, 195, 188)

        e.Graphics.DrawString("x=200, y=193", Me.Font, Brushes.LightCyan, 190, 208)





        '円C(緑) 

        e.Graphics.FillEllipse(Brushes.Green, 390, 183, 20, 20)

        e.Graphics.DrawString("C", Me.Font, Brushes.LightCyan, 395, 188)

        e.Graphics.DrawString("x=400, y=193", Me.Font, Brushes.LightCyan, 390, 208)



    End Sub

End Class

TranslateTransform の行と  ScaleTransformの行をコメントにすると、通常の座標系になるので、実行結果を比べてみると何が起こっているかわかると思います。

座標系を反転させた状態でDrawStringで文字を描画すると文字も反転してしまいます。文字を描画するときには適さないかもしれません。

文字だけ反転させないようにするには、反転を反転させるような処理が必要になり面倒です。反転を反転させるくらいなら、はじめから反転させないほうが楽です。この必要を感じるならば私はY軸を反転させないで別のアプローチでイヨさんが実現したいことを実現させるのが良いと思います。実現したいことが何なのかわからないので、それがどういうことなのかはなんともわかりませんが。