そういうことでしたら、自分で座標を変換する関数を作成して、その都度呼び出すのが良いと思います。

下記の例では、VB(.NET)の座標系を学校座標系(左下が原点、Y軸は上方向がプラス)に変換する関数 PointToSchoolを作成し呼び出すことで、Labelに学校座標系を表示します。

Private Sub Form1_Click(sender As Object, e As EventArgs) Handles Me.Click

    Dim sp As System.Drawing.Point = System.Windows.Forms.Cursor.Position

    Dim cp As System.Drawing.Point = Me.PointToClient(sp)

    Dim schoolP As System.Drawing.Point = Me.PointToSchool(cp)

    Dim x As Integer = schoolP.X

    Dim y As Integer = schoolP.Y

    Label1.Text = "X:" & x & "Y:" & y & ""

End Sub



''' <summary> 

''' 座標を学校座標系に変換します。 

''' </summary> 

''' <returns></returns> 

Private Function PointToSchool(p As Point) As Point



    Dim x As Integer = p.X

    Dim y As Integer = Me.ClientSize.Height - p.Y

    Return New Point(x, y)



End Function

>Graphicsクラスにしか適用にならないのでしょうか？
そうなんです。最初の投稿で紹介した TranslateTransformメソッドとScaleTransformメソッドは、Graphicsクラスを使う場合にしか役に立ちません。