インストーラー作成

インストーラーを自分で作れることを最近知ったのですが、作り方が分りません。セットアッププロジェクトを新規作成するところまではできたのですが・・・
また、自分で作ったインストーラーと、「発行」で自動でできる物にはどのような違いがあるのですか？
環境　VisualStudio２００８

セットアッププロジェクトに関する公式のドキュメントは
MSDN: Windows インストーラ配置のタスク
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/ybshs20f(v=VS.90).aspx
になるでしょうか。この中でも，
MSDN: 方法 : 配置プロジェクトに項目を追加する
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/z11b431t(v=VS.90).aspx
が中心になると思います。

SetupプロジェクトによるWindows Installerによる配置と，ClickOnce配置 (発行によるもの) の違いは，
MSDN: 配置ストラテジの選択
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/e2444w33(v=VS.90).aspx
や，少し古いですが，
MSDN: ClickOnce と Windows インストーラの使い分け
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/ms973805.aspx
を参考にしてください。
後者には，比較表がありますので，参考になるかとおもいます。


ちなみに，Windows Installer作成方法としては，他にWiXというものもあります。
SITE: Windows Installer XML (WiX) toolset
http://wix.sourceforge.net/
ただし，これによる作成はSetupプロジェクトより格段に難しくなりますが，その分，柔軟性があがります。
これに関しては，公式ドキュメントの他に，
SITE: WiX Tutorial — Introduction to the Windows Installer XML Toolset
http://www.tramontana.co.hu/wix/
およびsoftark.netさんが翻訳された
SITE: WiX チュートリアル (日本語訳) — Windows Installer XML ツールセット入門
http://www.softark.net/wix/index.html
というチュートリアルがあります。

参照URLのご提示有難う御座います。何とか分りそうです。

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Visual Basic 2008 Express で本格的なインストーラーパッケージを作りたいのですが…。
なにかいい方法ありますでしょうか？

似た質問であっても，新しい質問は新しく投稿するようにしましょう。
後から検索する場合に，ややこしくなりますので。

インストーラーパッケージを作るなら，
・お金があるならInstallShield
・そうでないなら WiX ( http://wixtoolset.org/ )
でしょうか。
VS Setup Projectはあまりカスタマイズできないので「本格的」という感じはないので……。

有り難うございます。WIXでインストーラーを作ってみます。